O Programa de Pós-graduação Stricto sensu em Biodiversidade e Saúde constitui-se por duas áreas de Concentração: Saúde ambiental e Taxonomia e sistemática. Neste conjunto, estão contidas 10 Linhas de Pesquisa:

Saúde ambiental:
- Biomonitoramento e ecologia de ecossistemas
- Bionomia e monitoramento de invertebrados de interesse em saúde global ou forense
- Controle de invertebrados de interesse em saúde global
- Ecologia parasitária
- Educação em Biodiversidade e Saúde
- Estudos interdisciplinares sobre vertebrados, com ênfase em hospedeiros e reservatórios de patógenos zoonóticos

Taxonomia e sistemática:
- Pesquisa e curadoria em coleções biológicas
- Taxonomia e caracterização microbiológica
- Taxonomia, sistemática e biogeografia de invertebrados de interesse em saúde global
- Taxonomia, sistemática e biogeografia de vertebrados, com ênfase em hospedeiros e reservatórios de patógenos zoonóticos